Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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