Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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