Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNB2Q08289 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms