Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms