Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms