Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms