Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN7AQ01118 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms