Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms