Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms