Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms