Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA9P57773 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms