Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF10P55107 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF10P55107 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms