Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms