Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPFP49454 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPFP49454 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPFP49454 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPFP49454 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CENPFP49454 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPFP49454 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPFP49454 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPFP49454 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPFP49454 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPFP49454 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPFP49454 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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