Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ME1P48163 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ME1P48163 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ME1P48163 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms