Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms