Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD13P35453 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms