Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms