Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC1P35052 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC1P35052 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GPC1P35052 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms