Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PSMB9P28065 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms