Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms