Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms