Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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