Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms