Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRAP18433 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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