Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF4P18085 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF4P18085 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF4P18085 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms