Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPB42P16452 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms