Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PEPDP12955 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PEPDP12955 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PEPDP12955 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEPDP12955 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PEPDP12955 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PEPDP12955 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PEPDP12955 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PEPDP12955 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PEPDP12955 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PEPDP12955 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PEPDP12955 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEPDP12955 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEPDP12955 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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