Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms