Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms