Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms