Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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