Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNC1O60486 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms