Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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