Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COCHO43405 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COCHO43405 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COCHO43405 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COCHO43405 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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