Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293 ms