Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms