Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS37CA5D8V6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms