Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3AQ9Y6K1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3AQ9Y6K1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms