Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP20Q9Y6A4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP20Q9Y6A4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms