Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX9Q9Y5X1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX9Q9Y5X1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms