Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN16Q9Y5I7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN16Q9Y5I7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms