Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC42Q9Y546 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC42Q9Y546 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC42Q9Y546 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC42Q9Y546 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms