Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAB1Q9Y478 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAB1Q9Y478 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms