Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT11Q9UKZ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms