Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP50Q9UKX7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP50Q9UKX7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms