Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3Q9UKS6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3Q9UKS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms