Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACL1Q9UJ83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HACL1Q9UJ83 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms