Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAX2Q9UIW0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms