Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX1-2Q9UD57 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX1-2Q9UD57 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms